وقد أنشأ الاتحاد الأوروبي خمس مؤسسات أساسية لتسيير أعماله، وهي:
- البرلمان الأوروبي (European Parliament): يتم انتخاب أعضائه مباشرة من قبل ناخبي الدول الأعضاء ولمدة 5 سنوات، وله دور تشريعي.
- المفوضية الأوروبية (European Commission): هي الجهاز التنفيذي للاتحاد وتعتبر أهم جهاز فيه، وتتشكل من 27 شخصية تقترحها الدول الأعضاء، ولكنها تعمل مستقلة عن السلطات الوطنية لكل منها. تعتبر هذة المفوضية محرك الآلة الاتحادية، وتتحمل مسؤولية تقديم مقترحات تشريعية إضافة إلى مباشرة الوظيفة التنفيذية والدفاع عن المصالح العامة للاتحاد الأوروبي والقيام بدور الحارس الساهر على احترام المعاهدات وعلى تطبيق قانون الاتحاد الأوروبي، تحت رقابة محكمة العدل في هذا الاتحاد. وبموجب التجديدات التي ادخلتها معاهدة لشبونة، يصبح الممثل السامي للاتحاد الأوروبي للشؤون الخارجية وسياسة الأمن عضواً في المفوضية حيث يتمتع بوظائف نائب رئيس المفوضية.
- مجلس الاتحاد الأوروبي (Council of European Union): هو الجهاز التشريعي للاتحاد ويضم الوزراء حسب التخصص من كل الدول الأعضاء، يدرس القوانين، وينسق السياسات العامة بين هذه الدول والخارج.